Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gabpb2P81069 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms