Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx3P81067 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx3P81067 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms