Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprn2P80560 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ptprn2P80560 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ptprn2P80560 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ptprn2P80560 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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