Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms