Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ldb1P70662 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ldb1P70662 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ldb1P70662 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ldb1P70662 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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