Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad1P70340 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms