Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfi1P70338 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms