Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cux2P70298 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms