Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms