Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pkn1P70268 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms