Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms