Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crnkl1P63154 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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