Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpl23P62830 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl23P62830 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl23P62830 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl23P62830 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms