Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms