Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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