Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PlnP61014 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PlnP61014 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PlnP61014 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PlnP61014 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms