Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Paxbp1P58501 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms