Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcstnP57716 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcstnP57716 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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NcstnP57716 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NcstnP57716 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcstnP57716 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcstnP57716 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcstnP57716 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NcstnP57716 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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