Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms