Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SmoP56726 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SmoP56726 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SmoP56726 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SmoP56726 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SmoP56726 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SmoP56726 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SmoP56726 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SmoP56726 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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