Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms