Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms