Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms