Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NrlP54846 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NrlP54846 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NrlP54846 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NrlP54846 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms