Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms