Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox5P52651 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms