Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms