Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfP51642 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfP51642 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CntfP51642 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CntfP51642 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CntfP51642 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CntfP51642 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CntfP51642 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CntfP51642 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CntfP51642 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CntfP51642 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CntfP51642 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CntfP51642 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfP51642 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfP51642 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CntfP51642 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms