Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms