Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpdP50404 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms