Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CitP49025 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CitP49025 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CitP49025 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms