Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms