Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13P47963 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms