Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Resp18P47939 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms