Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms