Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msh2P43247 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msh2P43247 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msh2P43247 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msh2P43247 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msh2P43247 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msh2P43247 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms