Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf5P43027 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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