Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3caP42337 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms