Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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