Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms