Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms