Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpargP37238 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpargP37238 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpargP37238 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpargP37238 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpargP37238 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpargP37238 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpargP37238 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpargP37238 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpargP37238 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpargP37238 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpargP37238 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpargP37238 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms