Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr2P35343 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr2P35343 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr2P35343 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr2P35343 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr2P35343 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr2P35343 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr2P35343 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr2P35343 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr2P35343 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr2P35343 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cxcr2P35343 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cxcr2P35343 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms