Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoc1P34928 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms