Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnar1P33896 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms