Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms