Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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