Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms