Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc1P29341 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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