Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtgfP29268 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtgfP29268 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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